电視剧按时间从前到后：
《星际迷航深空9号：进取号》简称ENT剧情主要发生在22世纪，但少量涉及时空冷战
《星际迷航深空9号：发现号》简称DIS/DSC目前为止最新一部，剧情发生在23世纪TOS前10年
《星际迷航深空9号：原初系列》简称TOS，拍摄时间最早剧情发生在23世纪，DSC后10年
《星际迷航深涳9号：下一代》简称TNG剧情发生在24世纪中后期
《星际迷航深空9号：深空九站》简称DS9/DSN，剧情发生在24世纪晚期与TNG和VOY有所关联
《星际迷航深空9號：航海家号》简称VOY，剧情发生在24世纪晚期与TNG和DS9有所关联
（TNG末期和DS9初期时间线上重叠，VOY与DS9在时间线上也有部分重叠）
电影1-6（有时被称为TMP）发生在23世纪末到24世纪初介于TOS与TNG之间
电影9发生在DS9后期
电影10发生在VOY后
国内引进的新版电影电影11-13属于"开尔文时间线"，剧情和主时间线（上述電视剧和10部老版电影）关系不大