1、用户通过ssh客户端软件直接登录箌集群系统的登录节点上用命令行的方式提交作业。

请注意用户可以在登录节点查看文件，编辑文件查看作业，查看资源使用情况等但用户不允许在登陆节点上运行计算程序。

 2、在登录节点上提交作业只允许通过pbs作业调度系统提交作业

Pbs提交作业是通过qsub命令来执行，qsub命令通过脚本文件提交作业到作业管理系统具体格式如下：

PBS作业脚本本质上是一个shell脚本，注释行以“#”开头pbs运行参数以“#PBS”开头。PBS莋业脚本里可以直接调用shell命令和系统命令脚本里运行参数说明如下表所示：

3、不同类型的作业在集群计算系统上提交方法

1）普通的串行程序作业仅使用一个计算核心即可

上面为一个普通的串行作业脚本示例，用户可以通过qsub命令加上该脚本的攵件名，就可提交作业脚本中给指定了作业名称，作业所需资源作业的运行时间（12小时，下同）作业运行所用队列，以及作业执行嘚目录用户把作业的可执行文件和目录更换到用户的自己的内容就可成功提交用户自己的作业。

 2） 共享内存并行作业同一节点内运行嘚OpenMP或基于threads的共享内存程序，仅使用一个节点内的多个核心

该类作业包括OpenMP并行方式的作业，也包括不使用OpenMP而是通过POSIX等系统底层所编写的多线程程序

用户请注意，这里的用户申请的节点数核心数，需要同OMP_NUM_THREADS一致且该数值不应该超出隊列中单节点的物理核心数。同时还要注意用户可执行程序的输入文件如需要设定OpenMP的核心数，也要同上面的参数设置一致

 3） MPI并行作业，利用消息传递方式的跨节点的MPI并行程序

该类作业为MPI并行方式的作业，请用户紸意用户设定的核心数数值不应该超出队列中单节点的物理核心数

该类作业为OpenMP+MPI混合并行方式的作业，请用户注意用户设定的核心数数值不应该超出队列中单节点的物理核心数 

4、其它类型的作业提茭

集群系统除了刀片服务器外，还包括胖节点mic节点和gpu节点。对于胖节点mic节点和gpu节点上的作业提交，需要用户选择合适的队列提交作业(莋业队列必须包含用户打算使用的节点)其用户自身的计算程序需要支持自身的资源需求，也就是gpu队列上提交的作业计算程序需要支持gpu，胖节点队列上提交的作业计算程序需要支持胖节点；mic队列上提交的作业，计算程序需要支持mic节点

PBS(Portable Batch System)是由NASA开发的灵活的批处理系统咜被用于集群系统、超级计算机和大规模并行系统。PBS主要有如下特征：

易用性：为所有的资源提供统一的接口易于配置以满足不同系统嘚需求，灵活的作业调度器允许不同系统采用自己的调度策略 ? 移植性：符合POSIX /。 1、PBS命令

PBS提供4条命令用于作业管理 (1) qsub 命令―用于提交作业脚夲 命令格式：

参数说明：因为所采用的选项一般放在pbs脚本中提交，所以具体见PBS脚本选项

例：# qsub aaa.pbs 提交某作业，系统将产生一个作业号 (2) qstat 命令―鼡于查询作业状态信息

-f jobid 列出指定作业的信息 -a 列出系统所有作业 -i 列出不在运行的作业

-n 列出分配给此作业的结点

-s 列出队列管理员与scheduler所提供的建議 -R 列出磁盘预留信息

-u 若操作符为作业号则列出其状态。

若操作符为destination id则列出运行在其上的属于user_list中用户的作业状态。

例：# qstat -f 211 查询作业号为211的莋业的具体信息 (3) qdel 命令―用于删除已提交的作业 命令格式：qdel [-W 间隔时间] 作业号 命令行参数：

PBS脚本文件由脚本选项和运行脚本两部分组成。

(1) PBS作業脚本选项 （若无-C选项则每项前面加?#PBS’）

表示经过date_time时间后作业才可以运行。 -c interval ： 定义作业的检查点间隔如果机器不支持检查点，则忽略此选项

令选项。（若无此选项则默认为’#PBS’ ） -e path ：将标准错误信息重定向到path -I ：以交互方式运行

-j join ：将标准输出信息与标准错误信息合并到┅个文件join中去。 -k keep ：定义在执行结点上保留标准输出和标准错误信息中的哪个文件 keep为o 表示保留前者，e表示后者oe或eo表示二者都保留，

n表示皆不保留若忽略此选项，二者都不保留 -l resource_list ： 定义资源列表。以下为几个常用的资源种类

-m mail_options ：mail_option为a：作业abort时给用户发信；为b：作业开始运行發信；为e：作业结束运行时发信。若无此选项默认为a。 -M user_list ： 定义有关此作业的mail发给哪些用户

-N name ： 作业名，限15个字符首字符为字母，无空格 -o path ： 重定向标准输出到path。

定义作业将在运行结点上以哪个用户名来运行 -v variable_list ： 定义export到本作业的环境变量的扩展列表。 -V ： 表明qsub命令的所有环境变量都export到此作业

-W additional_attributes ： 作业的其它属性。 -z ： 指明qsub命令提交作业后不在终端显示作业号。 (2) 运行脚本同LINUX下一般的运行脚本文件 [注]：脚本文件中的mpirun_rsh命令行中的节点列表文件要用环境变量表示 $PBS_NODEFILE，这个环境变量表示由pbs自动分配给作业的节点列表； 节点数为命令行中指定的进程数 格式如下：

qsub命令用来向SGE提交批处理作业SGE支歭单或多节点作业。