域境自隋至清分属青田县柔远乡仈内都和永嘉县、安固县、瑞安县嘉屿乡、嘉义乡五十一都、五十二都

民国37年(1948)，划归文成县管辖域境分属南田区岙里乡、三阳乡、初陽乡，大峃区大峃镇、龙凤乡

【中华人民共和国成立后】

1949年9月，分属鳌里、初阳、大峃、龙川4乡镇1950年，敖里乡析置石西乡；撤销初阳鄉析置篁庄乡、二源乡，属南田区管辖1952年4月石西乡撤销，析置石庄、西里两乡连同篁庄乡改属西坑区；大峃区徐珊乡划出岭头、新亭，龙川乡划出黄呈、垄山等村建黄岭乡；初湖乡从二源乡析置1956年3月石庄、篁庄两乡合并复称石西乡，重归南田区；初湖乡复并入二源鄉；同年9月乡改称乡人民委员会1958年，公社化时乡改称生产大队1959年3月又改称管理区。1961年石西管理区撤销，建立百丈漈人民公社；黄岭管理区改称黄岭人民公社；二源管理区改称二源人民公社1981年百丈漈公社改名为石庄公社。1984年4月复称石庄乡、黄岭乡、二源乡。1985年6月从石庄乡析置篁庄乡1992年5月撤朱阳、新东2乡并入二源乡；石庄、篁庄、黄岭3乡合并为百丈漈镇。2011年4月二源乡和富岙乡盖后村并入百丈漈镇

百丈漈是全县唯一具备农业、工业、旅游业三大平台的乡镇。 2011年全镇实现工农业总产值 。