自外来宗教传入并形成多种宗教并存格局以来，新疆始终保持了这一基本格局。“三股势力”特别是宗教极端势力却罔顾历史事实，不仅歪曲和杜撰新疆宗教演变的历史，否认新疆自古以来就是多民族聚居、多种宗教并存的地区，而且极力破坏新疆多种宗教和谐并存的历史传统，甚至破坏和诋毁新疆传统伊斯兰教，其目的就是利用宗教进行分裂破坏活动。各族干部群众包括广大信教群众，一定要擦亮眼睛，明辨是非，认清其本质，并与之进行坚决斗争。第七讲多种宗教并存格局的发展

　　伊斯兰教成为新疆的主要宗教后，多种宗教并存的格局继续演变。原有的祆教、景教和摩尼教已消失无存，佛教、道教在一度衰落后有所复兴，藏传佛教、基督教、天主教和东正教又先后传入新疆，加入到多种宗教并存的格局中来。

　　伊斯兰教作为新疆的主要宗教，一是传播地域广大，遍及南北疆。二是信仰民族多。清朝时期，随着乌孜别克族和塔塔尔族的迁入，新疆信仰伊斯兰教的民族已有维吾尔、哈萨克、回、柯尔克孜、塔吉克、乌孜别克、塔塔尔等七个民族。由于历史上这些民族基本上是全民信仰伊斯兰教，伊斯兰教对这些民族的政治、经济、文化、社会生活乃至民族心理，都产生了深远的影响。

　　这一时期，佛教在伊斯兰教的排挤下一度衰落，不见了昔日寺院林立、僧侣成群的盛况，信仰者只是在家中烧香拜佛，从事一些简单的佛事活动。但清朝统一新疆，特别是驱逐阿古柏匪帮后，随着内地信仰佛教的官兵、商贾和百姓的到来，佛教在新疆又逐渐复兴起来。在汉人较集中的哈密、巴里坤、木垒、吉木萨尔、阜康、乌鲁木齐、奇台、昌吉、伊犁等天山北坡各地，都重新建立了佛教的寺院。甚至在伊斯兰教势力强盛的南疆地区，也出现了佛教的庙宇。据不完全统计，新中国建立前，新疆共有汉传佛教寺院20余座。

　　藏传佛教即俗称的喇嘛教，是佛教传入西藏后，融合当地的苯教而形成的具有藏族特点的佛教。

　　藏传佛教传入新疆的时间，史无明载。唐代，吐蕃屡入新疆，与唐朝、大食争夺西域。虽然迄今为止还没有发现这一时期藏传佛教的文化遗存，但毋庸置疑的是，信仰藏传佛教的吐蕃在新疆的长期活动，必然把这一宗教带入新疆。近代以来在和田地区发现的藏传佛教的“欢喜佛”塑像，在吐鲁番地区发现的藏文佛经，马面观音、十一面观音等壁画，有人认为是10世纪至11世纪藏传佛教的文物。但这一时期吐蕃早已退出新疆，所以我们认为这些文物应属唐代遗存。时间约为唐朝中晚期。这一时期，应是藏传佛教传入新疆的时间。

　　有关藏传佛教在新疆的早期传播情况，目前尚不清楚。但从藏传佛教文物的分布可以推断，在和田、吐鲁番这些吐蕃活动时间较长的地区，藏传佛教比较流行。吐蕃退出新疆后，藏传佛教也随之日趋式微。但在喀喇汗王朝和于阗李氏王朝的宗教战争期间，原为政治对手的于阗和吐蕃，由于都信仰藏传佛教，因此出于共同对付伊斯兰教的目的，双方抛弃前嫌，加强了联系，斯坦因认为，吐蕃还通过奠居在拉达克及西部领土的显然属于突厥种的首领来支援于阗。这种密切联系，必然扩大藏传佛教在于阗的影响，促进该教在于阗的流传。

　　西辽至蒙元时期，由于实行宗教宽容政策，藏传佛教在新疆也有所复兴。蒙哥汗时期，就有许多维吾尔族人信仰了藏传佛教。当时途经此地前往蒙古的法国小教友会修士威廉·鲁不鲁克，对维吾尔族信仰藏传佛教的情况就作了详细的记述：“所有他们的教士都把头发和胡子剃光，他们身穿桔黄色的长袍，并且自剃光头发之时起，就严守贞洁。他们住在一起，一二百人成为一个团体……不管他们走到哪里，他们手里总是拿着一串念珠（有一二百颗念珠），如同我们带着我们的念珠一样。他们经常重复地说这句话：Onmanbaccam（